МЕТОДИКА ОПРЕДЕЛЕНИЯ КОРОТКОЦЕПОЧЕЧНЫХ ЖИРНЫХ КИСЛОТ В СЛЮНЕ ЧЕЛОВЕКА МЕТОДОМ ГАЗОЖИДКОСТНОЙ ХРОМАТОГРАФИИ

Аннотация

Изучение функциональной активности микробиоты становится неотъемлемой частью микробиологических исследований. Таким образом становится возможной оценка влияния некультивируемых микроорганизмов, вирусов на функциональную активность микробиты, появляется возможность говорить о микробиоте, как о едином целом. Кроме того, изменения в функциональной активности микробиоты могут говорить о патологических процессах в ней происходящих, в том числе о нарушении колонизационной резистентности, которая считается одним из ключевых факторов генерализации инфекционного процесса, что дает возможность говорить о том, что оценка функциональной активности микробиоты потенциально имеет и диагностическое практическое применение. Признанным методом оценки функциональной активности микробиоты является определение концентраций короткоцепочечных жирных кислот в биологических средах (слюне, кале). Данный анализ проводится методом газо-жидкостной хроматографии и является доступным и сравнительно недорогим методом. Однако широкому внедрению данного анализа препятствует в том числе невозможность стандартизации результатов анализов, полученных на разных хроматографах. В представленной статье описан процесс проведения анализов на двух хроматографических колонках, стандартизованной и авторской, и сравнительный анализ полученных результатов.
Ключевые слова: микробиота; короткоцепочечные жирные кислоты (КЖК); газожидкостная хроматография; метаболомика; мета-метаболомика; линейный дискриминантный анализ; инфекции, связанные с оказанием медицинской помощи (ИСМП)

Annotation

The study of the functional activity of the microbiota is becoming an integral part of microbiological research. This approach enables the assessment of the influence of uncultivable microorganisms and viruses on the functional activity of the microbiota, making it possible to consider the microbiota as a unified system. Furthermore, alterations in the functional activity of the microbiota may serve as indicators of pathological processes, including disturbances in colonization resistance, which is regarded as one of the key factors in the generalization of infectious processes. This suggests that the evaluation of microbiota functional activity potentially possesses diagnostic and practical applications. A recognized method for assessing the functional activity of the microbiota is the determination of short-chain fatty acid concentrations in biological media (such as saliva and feces). This analysis is performed using gas–liquid chromatography and is considered accessible and relatively inexpensive. However, the widespread implementation of this method is hindered, among other factors, by the inability to standardize results obtained from different chromatographs. The present article describes the process of conducting analyses using two chromatographic columns—one standardized and one custom-designed—and provides a comparative evaluation of the results obtained.
Key words: microbiota, short-chain fatty acids (SCFAs), gas–liquid chromatography, metabolomics, meta-metabolomics, One Health, linear discriminant analysis, healthcare-associated infections (HAIs)

Об авторах

Список литературы

Ключевые слова